MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula marismortui ATCC 43049 chromosome I

Total Repeats: 65341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006396	GC	3	6	87	92	0 %	0 %	50 %	50 %	55376943
2	NC_006396	GACCCG	2	12	145	156	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	55376943
3	NC_006396	CGT	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
4	NC_006396	CGA	2	6	192	197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376943
5	NC_006396	TTC	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376943
6	NC_006396	GA	3	6	287	292	50 %	0 %	50 %	0 %	55376943
7	NC_006396	TCG	2	6	294	299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
8	NC_006396	CTG	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
9	NC_006396	ACG	2	6	356	361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376943
10	NC_006396	CTC	2	6	421	426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376943
11	NC_006396	CGT	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
12	NC_006396	GCC	2	6	491	496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376943
13	NC_006396	CCG	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376943
14	NC_006396	GCC	2	6	625	630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376943
15	NC_006396	TCG	2	6	638	643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
16	NC_006396	CAC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376943
17	NC_006396	GCGT	2	8	691	698	0 %	25 %	50 %	25 %	55376943
18	NC_006396	CGT	2	6	804	809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
19	NC_006396	GA	3	6	870	875	50 %	0 %	50 %	0 %	55376943
20	NC_006396	TCG	2	6	884	889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376943
21	NC_006396	GT	3	6	945	950	0 %	50 %	50 %	0 %	55376943
22	NC_006396	CGT	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
23	NC_006396	GCC	2	6	1091	1096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
24	NC_006396	CA	3	6	1139	1144	50 %	0 %	0 %	50 %	55376944
25	NC_006396	TCG	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
26	NC_006396	CCT	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
27	NC_006396	CGG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376944
28	NC_006396	TGG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376944
29	NC_006396	GCC	2	6	1250	1255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
30	NC_006396	TGGC	2	8	1292	1299	0 %	25 %	50 %	25 %	55376944
31	NC_006396	CGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
32	NC_006396	TCCTCG	2	12	1413	1424	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	55376944
33	NC_006396	CTT	2	6	1471	1476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
34	NC_006396	TCG	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
35	NC_006396	GT	4	8	1518	1525	0 %	50 %	50 %	0 %	55376944
36	NC_006396	GGAAC	2	10	1564	1573	40 %	0 %	40 %	20 %	55376944
37	NC_006396	CTC	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
38	NC_006396	CCG	2	6	1647	1652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
39	NC_006396	TGA	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376944
40	NC_006396	ATC	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376944
41	NC_006396	GTC	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
42	NC_006396	CGT	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
43	NC_006396	CGG	2	6	1745	1750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376944
44	NC_006396	GCC	2	6	1769	1774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
45	NC_006396	GTC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
46	NC_006396	GCG	2	6	1797	1802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376944
47	NC_006396	CGT	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376944
48	NC_006396	CGATGT	2	12	1906	1917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	55376944
49	NC_006396	CCT	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
50	NC_006396	CGGT	2	8	2016	2023	0 %	25 %	50 %	25 %	55376944
51	NC_006396	CGA	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
52	NC_006396	GTA	2	6	2060	2065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376944
53	NC_006396	CGC	2	6	2080	2085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
54	NC_006396	TCT	2	6	2104	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
55	NC_006396	CTC	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
56	NC_006396	TGG	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376944
57	NC_006396	GAGC	2	8	2174	2181	25 %	0 %	50 %	25 %	55376944
58	NC_006396	GTG	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55376944
59	NC_006396	CTCC	2	8	2302	2309	0 %	25 %	0 %	75 %	55376944
60	NC_006396	TTC	2	6	2330	2335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
61	NC_006396	CTT	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
62	NC_006396	GCC	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376944
63	NC_006396	ACC	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55376944
64	NC_006396	CGA	2	6	2431	2436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
65	NC_006396	GTCG	2	8	2459	2466	0 %	25 %	50 %	25 %	55376944
66	NC_006396	TCT	2	6	2518	2523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55376944
67	NC_006396	ACTC	2	8	2542	2549	25 %	25 %	0 %	50 %	55376944
68	NC_006396	CCGT	2	8	2571	2578	0 %	25 %	25 %	50 %	55376944
69	NC_006396	CG	4	8	2587	2594	0 %	0 %	50 %	50 %	55376944
70	NC_006396	CTC	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376944
71	NC_006396	GC	3	6	2811	2816	0 %	0 %	50 %	50 %	55376944
72	NC_006396	CGA	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376944
73	NC_006396	CGGC	2	8	3025	3032	0 %	0 %	50 %	50 %	55376945
74	NC_006396	GTCG	2	8	3045	3052	0 %	25 %	50 %	25 %	55376945
75	NC_006396	CGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376945
76	NC_006396	GCC	2	6	3148	3153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376945
77	NC_006396	GCC	2	6	3157	3162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376945
78	NC_006396	GCT	2	6	3169	3174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376945
79	NC_006396	CGGT	2	8	3187	3194	0 %	25 %	50 %	25 %	55376945
80	NC_006396	AGC	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376945
81	NC_006396	CGT	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376945
82	NC_006396	GCG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376945
83	NC_006396	GCC	2	6	3307	3312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376945
84	NC_006396	GGA	2	6	3370	3375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376946
85	NC_006396	GTC	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
86	NC_006396	CGGG	2	8	3398	3405	0 %	0 %	75 %	25 %	55376946
87	NC_006396	TCG	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
88	NC_006396	TCG	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
89	NC_006396	GGC	2	6	3499	3504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
90	NC_006396	CGT	2	6	3514	3519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
91	NC_006396	TCC	2	6	3525	3530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376946
92	NC_006396	TCG	3	9	3534	3542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
93	NC_006396	CGG	2	6	3586	3591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
94	NC_006396	CGT	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
95	NC_006396	CCG	2	6	3651	3656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
96	NC_006396	TGA	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
97	NC_006396	TGA	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
98	NC_006396	CGA	2	6	3784	3789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
99	NC_006396	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	55376946
100	NC_006396	GAA	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376946
101	NC_006396	TCG	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
102	NC_006396	CGA	2	6	4000	4005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
103	NC_006396	GTC	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
104	NC_006396	CGG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
105	NC_006396	GTT	2	6	4115	4120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55376946
106	NC_006396	GAG	2	6	4136	4141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376946
107	NC_006396	GTC	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
108	NC_006396	CGG	2	6	4174	4179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
109	NC_006396	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
110	NC_006396	TCG	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376946
111	NC_006396	CCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376946
112	NC_006396	TGA	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
113	NC_006396	CGC	2	6	4351	4356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
114	NC_006396	ATG	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376946
115	NC_006396	GAC	2	6	4391	4396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
116	NC_006396	CCT	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376946
117	NC_006396	CG	3	6	4467	4472	0 %	0 %	50 %	50 %	55376946
118	NC_006396	CGG	2	6	4474	4479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376946
119	NC_006396	CCG	2	6	4569	4574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376946
120	NC_006396	CGA	3	9	4633	4641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376946
121	NC_006396	GCG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376947
122	NC_006396	TCC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376947
123	NC_006396	CCGA	2	8	5420	5427	25 %	0 %	25 %	50 %	55376947
124	NC_006396	CG	3	6	5443	5448	0 %	0 %	50 %	50 %	55376947
125	NC_006396	CCACG	2	10	5449	5458	20 %	0 %	20 %	60 %	55376947
126	NC_006396	GTC	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376947
127	NC_006396	TGGC	2	8	5473	5480	0 %	25 %	50 %	25 %	55376947
128	NC_006396	CGA	4	12	5515	5526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376947
129	NC_006396	CGC	2	6	5573	5578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376947
130	NC_006396	ACG	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376947
131	NC_006396	TCG	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376948
132	NC_006396	CGGC	2	8	5756	5763	0 %	0 %	50 %	50 %	55376948
133	NC_006396	ATCG	2	8	5772	5779	25 %	25 %	25 %	25 %	55376948
134	NC_006396	GTC	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376948
135	NC_006396	CAG	2	6	5811	5816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376948
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258	NC_006396	GAC	2	6	11903	11908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
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260	NC_006396	GAC	2	6	11956	11961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
261	NC_006396	ACGGA	2	10	12009	12018	40 %	0 %	40 %	20 %	55376954
262	NC_006396	GGA	2	6	12040	12045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376954
263	NC_006396	GTC	2	6	12077	12082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376954
264	NC_006396	ACT	2	6	12090	12095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55376954
265	NC_006396	CGC	2	6	12189	12194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376954
266	NC_006396	CGA	2	6	12208	12213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
267	NC_006396	CACG	2	8	12214	12221	25 %	0 %	25 %	50 %	55376954
268	NC_006396	GTC	2	6	12245	12250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376954
269	NC_006396	CGT	2	6	12268	12273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376954
270	NC_006396	GATC	2	8	12316	12323	25 %	25 %	25 %	25 %	55376954
271	NC_006396	GAT	2	6	12421	12426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55376954
272	NC_006396	ACAG	2	8	12506	12513	50 %	0 %	25 %	25 %	55376954
273	NC_006396	GATCA	2	10	12599	12608	40 %	20 %	20 %	20 %	55376954
274	NC_006396	CGT	2	6	12640	12645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376954
275	NC_006396	CGG	2	6	12673	12678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376954
276	NC_006396	GCG	2	6	12697	12702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376954
277	NC_006396	ATA	2	6	12801	12806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55376954
278	NC_006396	GGC	2	6	12865	12870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376954
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280	NC_006396	GCC	2	6	12986	12991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376954
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282	NC_006396	ACG	2	6	13067	13072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
283	NC_006396	CGA	2	6	13116	13121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
284	NC_006396	TCCAG	2	10	13128	13137	20 %	20 %	20 %	40 %	55376954
285	NC_006396	AGCA	2	8	13178	13185	50 %	0 %	25 %	25 %	55376954
286	NC_006396	GAC	2	6	13219	13224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
287	NC_006396	CGG	2	6	13248	13253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55376954
288	NC_006396	CCT	2	6	13296	13301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55376954
289	NC_006396	CAG	2	6	13307	13312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
290	NC_006396	CGA	2	6	13441	13446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
291	NC_006396	CGA	2	6	13453	13458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
292	NC_006396	GCC	2	6	13535	13540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376954
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294	NC_006396	GTC	2	6	13571	13576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376954
295	NC_006396	GCC	2	6	13616	13621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376954
296	NC_006396	GAG	2	6	13727	13732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55376954
297	NC_006396	TCG	2	6	13755	13760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376954
298	NC_006396	CGA	2	6	13852	13857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376954
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300	NC_006396	TCAG	2	8	13869	13876	25 %	25 %	25 %	25 %	55376954
301	NC_006396	GAA	2	6	13937	13942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55376954
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382	NC_006396	ACG	2	6	18355	18360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376960
383	NC_006396	AC	3	6	18399	18404	50 %	0 %	0 %	50 %	55376960
384	NC_006396	TGAA	2	8	18482	18489	50 %	25 %	25 %	0 %	55376960
385	NC_006396	TCG	2	6	18523	18528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376960
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387	NC_006396	GCC	2	6	18565	18570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	55376960
388	NC_006396	CTG	2	6	18579	18584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376960
389	NC_006396	TCG	2	6	18659	18664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376960
390	NC_006396	CGA	2	6	18806	18811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376960
391	NC_006396	GCT	2	6	18869	18874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55376960
392	NC_006396	CAG	2	6	18896	18901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376960
393	NC_006396	CA	3	6	18983	18988	50 %	0 %	0 %	50 %	55376960
394	NC_006396	CGATT	2	10	18993	19002	20 %	40 %	20 %	20 %	55376960
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423	NC_006396	GCA	2	6	20920	20925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55376961
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